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siRNA,shRNA,dsRNA,miRNA間的區(qū)別

更新時(shí)間:2020-05-25      點(diǎn)擊次數(shù):2943

siRNA,shRNA,dsRNA,miRNA間的區(qū)別
RNA干擾(RNAi),即用20多個(gè)核苷酸組成的短的雙鏈RNA(siRNA)代替?zhèn)鹘y(tǒng)反義核酸進(jìn)行轉(zhuǎn)錄后基因沉默,已經(jīng)迅速而廣泛地應(yīng)用到基因功能,基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制研究等熱門領(lǐng)域,并為基因治療開辟了新的途徑。近兩年來,這方面的科學(xué)論文及報(bào)道爆炸性增長,幾乎每天都有新的結(jié)果涌現(xiàn)。這些論文中,出現(xiàn)了很多與RNA干擾相關(guān)的概念,意思很相近但并不*相同,這里列舉了幾個(gè)常見的RNA干擾相關(guān)的名詞及其簡單的解釋:
1、  miRNA:在遺傳學(xué)中,微RNA(microRNAs,miRNA)是長度在21-23個(gè)核苷酸之間的單鏈RNA   pian段,調(diào)節(jié)基因的表達(dá)。miRNA由基因編碼,從DNA轉(zhuǎn)錄而來,但不翻譯成蛋白。初級轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物(primary transcripts,pri-miRNA)縮短其頸環(huán)結(jié)構(gòu)得到功能性的miRNA。成熟的miRNA分子與一個(gè)或geng多個(gè)mRNA分子部分互補(bǔ),其主要功能是下調(diào)基因的表達(dá)。而microRNA這個(gè)概念di一次在2001年Science (26 October 2001)的文章中出現(xiàn)。
2、  dsRNA:雙鏈RNA(double-stranded RNA, dsRNA)是一種有互補(bǔ)鏈的RNA,與細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)的DNA相似,dsRNA構(gòu)成了一些病毒(雙鏈RNA病毒)的基因組。像病毒RNA或siRNA之類的雙鏈RNA能夠促發(fā)真核細(xì)胞中的RNA干擾,引起脊椎動物中的干擾素反應(yīng)。
3、  shRNA:小發(fā)卡或短發(fā)卡RNA(a small hairpin RNA or short hairpin RNA, shRNA)是一段具有緊密發(fā)卡環(huán)(tight hairpin turn)的RNA序列,常被用于RNA干擾沉默靶基因的表達(dá)。利用載體把shRNA導(dǎo)入細(xì)胞,載體中的U6 啟動子確保shRNA總是表達(dá);這種裝載了shRNA載體可被傳遞到子代細(xì)胞中去,從而使基因的沉默可被遺傳。shRNA的發(fā)卡結(jié)構(gòu)可被細(xì)胞機(jī)制切割成siRNA,然后siRNA結(jié)合到RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合物上(RNA-induced silencing complex,RISC),該復(fù)合物能夠結(jié)合到目的mRNAs并將其降解。shRNA 是由RNA 聚合酶Ⅲ轉(zhuǎn)錄的,哺乳細(xì)胞中的shRNA產(chǎn)物有時(shí)會促使細(xì)胞產(chǎn)生干擾素反應(yīng)(細(xì)胞遇到病毒侵襲時(shí)做出的自我防衛(wèi)反應(yīng)),而miRNA中卻不會遇到這種問題(miRNA是由RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄,與轉(zhuǎn)錄mRNA的聚合酶相同)。shRNA也被用于植物和其它系統(tǒng)中,在這些系統(tǒng)中不需要U6啟動子的驅(qū)動。在植物中,常用的增強(qiáng)表達(dá)的啟動子是CaMV35S(cauliflower mosaic virus 35S),在這種情況下,RNA聚合酶Ⅱ參與了轉(zhuǎn)錄,起始RNA干擾。
4、  siRNA:小或短干擾RNA(small/short interfering RNA, siRNA)是一類20-25個(gè)核苷酸長度的雙鏈RNA分子,其主要在RNAi通路中起作用,干擾特異基因的表達(dá)。此外siRNA在RNAi相關(guān)的通路中也起作用,如抗病毒機(jī)制,基因組染色體結(jié)構(gòu)的塑造等。其結(jié)構(gòu)是一段*互補(bǔ)的RNA雙鏈,兩端各有兩個(gè)未互補(bǔ)的的堿基。

end:做一下小結(jié),miRNA,siRNA,dsRNA和shRNA都是RNA干擾技術(shù)中用到的小分子RNA,其不同之處在miRNA 是單鏈RNA,其余均為雙鏈RNA;siRNA和dsRNA相似;shRNA需通過載體導(dǎo)入細(xì)胞后,然后利用細(xì)胞內(nèi)的酶切機(jī)制得到siRNA而終發(fā)揮RNA干擾作用。

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